Národní psolufinancování

Česká republika rozhodla, že míru spolufinancování bude vztahovat pouze k veřejným výdajům. Veřejné rozpočty CŘ budou muset v letech 2007 - 2015 (realizace projektů v závěru programovacího období může trvat dva roky od zahájení projektu) vydat minimálně 4,7 mld. eur, aby mohla ČR vyčerpat přidělenou alokaci v tomto programovacím období. Prioritou při přípravě všech veřejných rozpočtů je zajištění spolufinancování projektů a programů ze SF a FS. Bude třeba koordinovat plánování národních a evropských programů, národní programy budou podporovat jen ty oblasti, které nelze financovat z evropských zdrojů. Každé ministerstvo, které je zároveň řídícím orgánem, musí hledat finanční zdroje v rámci své kapitoly na zajištění spolufinancování operačního programu, který vypracovalo a do kterého mělo zapracovat především ty strategické cíle, které jsou v souladu s novou evropskou politikou soudržnosti.

Veškeré prostředky SF a FS jsou integrovány do státního rozpočtu. Příjemcům jsou prostředky SF a FS předfinancovány ze zdrojů státního rozpočtu. Platební a certifikační orgán následně převádí prostředky SF a FS do státního rozpočtu. Tímto bude zajištěn stejnoměrný a jednotný tok národních i evropských prostředků k příjemcům a mohlo by dojít ke zrychlení realizace projektů. Průměrné spolufinancování v poměru k celkové výši přidělených SF a FS z českých veřejných zdrojů by mělo činit 15%.